Protein–RNA interactions for Protein: P97432

Nbr1, Next to BRCA1 gene 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 988 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nbr1P97432 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Nbr1P97432 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nbr1P97432 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms