Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pkp1P97350 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms