Protein–RNA interactions for Protein: P97348

Rhod, Rho-related GTP-binding protein RhoD, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhodP97348 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Gm6754-201ENSMUST00000117124 913 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
RhodP97348 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
RhodP97348 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
RhodP97348 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms