Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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SgcgP82348 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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SgcgP82348 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SgcgP82348 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
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