Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Irx3P81067 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms