Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Ugt1a5-201ENSMUST00000097659 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rad50P70388 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms