Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Mfsd4b5-205ENSMUST00000170579 1554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm17111-201ENSMUST00000169981 411 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Traf5P70191 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms