Protein–RNA interactions for Protein: P63154

Crnkl1, Crooked neck-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 690 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crnkl1P63154 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Crnkl1P63154 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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