Protein–RNA interactions for Protein: P62878

Rbx1, E3 ubiquitin-protein ligase RBX1, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbx1P62878 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rbx1P62878 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
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