Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snap25P60879 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.3 ms