Protein–RNA interactions for Protein: P60824

Cirbp, Cold-inducible RNA-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CirbpP60824 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CirbpP60824 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Pcdh15-238ENSMUST00000193739 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 4933431E20Rik-201ENSMUST00000131345 5407 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
CirbpP60824 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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