Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Setd4P58467 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms