Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Strn4P58404 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Strn4P58404 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Strn4P58404 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms