Protein–RNA interactions for Protein: P57757

Ctns, Cystinosin, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtnsP57757 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtnsP57757 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms