Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NcstnP57716 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms