Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm15869-201ENSMUST00000126427 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Bace1P56818 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms