Protein–RNA interactions for Protein: P56183

Rrp1, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1P56183 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Hnrnpf-203ENSMUST00000167182 2271 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rrp1P56183 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rrp1P56183 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms