Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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Nub1P54729 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Nub1P54729 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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