Protein–RNA interactions for Protein: P54285

Cacnb3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb3P54285 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Cacnb3P54285 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cacnb3P54285 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms