Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PctpP53808 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PctpP53808 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Etf1-201ENSMUST00000025218 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PctpP53808 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PctpP53808 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PctpP53808 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PctpP53808 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PctpP53808 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.27
PctpP53808 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
PctpP53808 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
PctpP53808 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms