Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ube2e3P52483 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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