Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Defa8P50706 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms