Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rbp3P49194 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms