Protein–RNA interactions for Protein: P48985

Atoh1, Protein atonal homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh1P48985 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm2237-202ENSMUST00000170694 2090 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Atoh1P48985 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms