Protein–RNA interactions for Protein: P47806

Gli1, Zinc finger protein GLI1, mousemouse

Predictions only

Length 1,111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli1P47806 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Gli1P47806 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Gli1P47806 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Gli1P47806 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
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