Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SrprbP47758 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SrprbP47758 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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SrprbP47758 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SrprbP47758 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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