Protein–RNA interactions for Protein: P42209

Sept1, Septin-1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sept1P42209 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sept1P42209 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sept1P42209 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sept1P42209 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sept1P42209 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sept1P42209 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sept1P42209 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sept1P42209 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sept1P42209 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Sept1P42209 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sept1P42209 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sept1P42209 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sept1P42209 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Sept1P42209 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Sept1P42209 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept1P42209 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept1P42209 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Sept1P42209 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms