Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Apoc3P33622 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms