Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Itgal-201ENSMUST00000106306 5195 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Saa4P31532 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms