Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Hoxc11P31313 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
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Hoxc11P31313 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Hoxc11P31313 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Hoxc11P31313 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
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Hoxc11P31313 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Hoxc11P31313 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxc11P31313 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxc11P31313 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
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Hoxc11P31313 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Hoxc11P31313 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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