Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Pabpc1P29341 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Pabpc1P29341 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms