Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm12201-201ENSMUST00000120657 1234 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm43947-201ENSMUST00000203019 959 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gjb1P28230 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms