Protein–RNA interactions for Protein: P27659

Rpl3, 60S ribosomal protein L3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl3P27659 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rpl3P27659 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms