Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CftrP26361 Det1-202ENSMUST00000107431 1439 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CftrP26361 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CftrP26361 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CftrP26361 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CftrP26361 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CftrP26361 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CftrP26361 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CftrP26361 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CftrP26361 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CftrP26361 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CftrP26361 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CftrP26361 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CftrP26361 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CftrP26361 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CftrP26361 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CftrP26361 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CftrP26361 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CftrP26361 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CftrP26361 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CftrP26361 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CftrP26361 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CftrP26361 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CftrP26361 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CftrP26361 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CftrP26361 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CftrP26361 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms