Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ggta1P23336 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ggta1P23336 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Ggta1P23336 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ggta1P23336 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ggta1P23336 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ggta1P23336 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
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Ggta1P23336 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ggta1P23336 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ggta1P23336 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ggta1P23336 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ggta1P23336 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ggta1P23336 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ggta1P23336 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
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Ggta1P23336 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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