Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Tnnc2P20801 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Tnnc2P20801 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms