Protein–RNA interactions for Protein: P20490

Ms4a2, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a2P20490 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ms4a2P20490 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ms4a2P20490 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms