Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
VimP20152 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
VimP20152 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
VimP20152 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
VimP20152 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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