Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Zfand2a-202ENSMUST00000110851 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps6ka3P18654 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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