Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18528 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18528 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18528 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18528 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18528 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18528 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC10.96□□□□□ -0.66
P18528 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18528 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18528 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18528 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18528 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18528 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18528 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18528 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18528 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
P18528 4930458D05Rik-201ENSMUST00000142871 3055 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
P18528 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
P18528 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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