Protein–RNA interactions for Protein: P18052

Ptpra, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

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Length 829 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpraP18052 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PtpraP18052 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PtpraP18052 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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