Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
PcnaP17918 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ptgdr2-201ENSMUST00000037261 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
PcnaP17918 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms