Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RhoP15409 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RhoP15409 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RhoP15409 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RhoP15409 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
RhoP15409 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RhoP15409 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
RhoP15409 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Olfr54-201ENSMUST00000072152 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Olfr1375-201ENSMUST00000073543 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
RhoP15409 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RhoP15409 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RhoP15409 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RhoP15409 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RhoP15409 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RhoP15409 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
RhoP15409 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
RhoP15409 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
RhoP15409 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
RhoP15409 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms