Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FosbP13346 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FosbP13346 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FosbP13346 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FosbP13346 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FosbP13346 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FosbP13346 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FosbP13346 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FosbP13346 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FosbP13346 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FosbP13346 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FosbP13346 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FosbP13346 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FosbP13346 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FosbP13346 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FosbP13346 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FosbP13346 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FosbP13346 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FosbP13346 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FosbP13346 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FosbP13346 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FosbP13346 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FosbP13346 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FosbP13346 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FosbP13346 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FosbP13346 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FosbP13346 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FosbP13346 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FosbP13346 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FosbP13346 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
FosbP13346 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FosbP13346 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FosbP13346 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FosbP13346 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FosbP13346 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FosbP13346 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FosbP13346 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FosbP13346 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FosbP13346 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms