Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
DmdP11531 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm38139-201ENSMUST00000195806 704 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Rln1-201ENSMUST00000044143 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
DmdP11531 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
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DmdP11531 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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DmdP11531 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
DmdP11531 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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DmdP11531 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
DmdP11531 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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