Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
P10404 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P10404 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P10404 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P10404 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P10404 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
P10404 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P10404 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
P10404 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
P10404 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
P10404 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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