Protein–RNA interactions for Protein: P10146

Ccl1, C-C motif chemokine 1, mousemouse

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Length 92 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl1P10146 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Ccl1P10146 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms