Protein–RNA interactions for Protein: P09235

Ifna9, Interferon alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna9P09235 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ifna9P09235 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms