Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
PdgfrbP05622 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
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