Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
H2-Eb1P04230 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
H2-Eb1P04230 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms